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張文宏被舉報的博士論文究竟研究了些什么

來源:鳳凰網(wǎng)

張文宏的博士論文,研究的是結(jié)核桿菌最常見的兩種變異是否會導(dǎo)致耐藥嗎?

研究結(jié)果顯示,結(jié)核桿菌關(guān)鍵基因?qū)е碌牡鞍鬃儺愔校绻?15個位置發(fā)生了突變,那么耐藥會發(fā)生;如果第463個位置發(fā)生突變,很大可能不會導(dǎo)致耐藥。

被舉報存在高相似度的部分是論文的綜述,有研究人員表示,博士論文并不是都要發(fā)綜述,這部分可有可無。

震驚地得知當(dāng)張文宏醫(yī)生與“學(xué)術(shù)不端”一詞發(fā)生了聯(lián)系,學(xué)界內(nèi)外都頗為震驚。

作為一名科技記者,第一反應(yīng)是要看到張文宏的博士論文。

在萬方數(shù)據(jù)庫花了30元下載到論文全文,憑借粗淺的分子生物學(xué)背景和多年科技記者的學(xué)習(xí)判斷能力,試圖科普一下這篇《結(jié)核分支桿菌katG基因突變與其耐異肼機(jī)制的系列研究》(看標(biāo)題完全GET不到重點的研究)究竟做了什么工作。

回答這幾個問題:從哪里來?到哪里去?究竟有沒有用?

(1)研究對象是什么?從哪里來

萬事皆有出處,科學(xué)研究也一樣。

張文宏的博士論文要對付的是被稱為“白色瘟疫”的癆病,即肺結(jié)核。,順便科普一下,在我國傳染病疫情網(wǎng)絡(luò)報告中,肺結(jié)核發(fā)病和死亡數(shù)始終位居甲乙類傳染病之首。

一般的癆病有藥治,“異肼”之于癆病,就像“青蒿素”之于瘧疾。

但耐藥的癆病很難治,癆病的“青蒿素”一旦沒用了,就要上其他藥物(二線藥物),不僅貴還可能無效。

面對大量的耐藥結(jié)核病患者,臨床上希望有一種仿佛,一測就知道,哪些人身體攜帶里帶的結(jié)核桿菌變異了,致使治療癆病的“青蒿素”不管用了。

張文宏博士期間的研究就是希望把最常見的兩種變異(占臨床發(fā)現(xiàn)的70%)研究弄清楚,就好比研究新冠病毒的德爾塔變異株和拉姆達(dá)變異株,究竟該怎么治。

兩個突變都能導(dǎo)致耐藥嗎?回答了這個問題,就能實現(xiàn)精準(zhǔn)治療,免得讓患者花冤枉錢。

2000年,人類基因組計劃剛剛完成草圖的繪制,那時候,測個基因組需要十幾年。

正是在這樣的分子生物學(xué)技術(shù)前提下,張文宏的研究利用了原始的質(zhì)粒構(gòu)建方法,讓突變基因表達(dá)出蛋白,并進(jìn)行了基因變化與耐藥與否的驗證。

從臨床中發(fā)現(xiàn)問題,通過識別基因變異來推動精準(zhǔn)治療的實現(xiàn),這樣的研究即便是在現(xiàn)在也不落伍。

(2)得出什么結(jié)論?到哪里去

那么,張文宏的博士論文究竟做出了什么結(jié)果呢?

結(jié)核桿菌(癆病的致病菌)具有極高的致病,過往研究的難點在于研究人員很可能被感染。直接從結(jié)核桿菌中提取蛋白質(zhì)研究非常緩慢。

所謂工欲善其事必先利其器。

張文宏通過基因工程的方法讓大腸桿菌中也能表達(dá)結(jié)核桿菌里的蛋白,給自己的研究以及其他研究者的研究提供足夠的材料。

經(jīng)過反復(fù)驗證,張文宏的研究結(jié)果顯示了,結(jié)核桿菌關(guān)鍵基因?qū)е碌牡鞍鬃儺愔?,?15個位置如果發(fā)生了突變,那么耐藥會發(fā)生,而如果第463個位置發(fā)生突變,很大可能不會導(dǎo)致耐藥發(fā)生。這與臨床的一些病例也相符合。

2000年,冷凍電鏡這樣高大上的科研重器離中國的普通科研工作者還很遠(yuǎn),人們看不到蛋白質(zhì)的構(gòu)象,只能通過迂回的方法去推論,哪些變異引發(fā)了蛋白質(zhì)功能的變化,最終給疾病和治療帶來哪些影響。

研究中,張文宏利用了“最早證實katG基因與異肼耐藥相關(guān)”的當(dāng)時的最時髦技術(shù)(堪比現(xiàn)在的基因編輯),即電轉(zhuǎn)化技術(shù)完成研究。

(3)究竟有沒有用?

張文宏的研究表明,結(jié)核桿菌中最常見的兩種變異,一種會導(dǎo)致耐藥,而另一種不會,這項結(jié)果也解釋了過往的臨床病例中出現(xiàn)的奇怪現(xiàn)象。有了分子層面的結(jié)果,臨床上,結(jié)核病患者就可以通過突變位點的測序,分辨究竟有沒有耐藥,從而對癥下藥。

除了鑒定了一個有用的突變,張文宏的研究同時給出了方法和策略。

如何篩選對耐藥有價值的突變點,并對初步的突變體實施篩選與評估策略。這樣的方法如果能夠普及,從基礎(chǔ)研究走向臨床,從臨床中發(fā)現(xiàn)突變點,再做基礎(chǔ)研究驗證,如此循環(huán)往復(fù),將對耐藥的分子機(jī)理更加明晰。

科學(xué)研究從臨床中來,到臨床中去,張文宏后來身為感染科醫(yī)生一直在詮釋這樣的原則。

(4)高相似度的尷尬綜述部分

在張文宏的博士論文中,結(jié)構(gòu)清晰地介紹了3個部分的工作,每個部分中都有背景、研究方法、結(jié)果、討論等,其中也詳細(xì)介紹了包括參考文獻(xiàn)、試劑、菌株、序列等的來源。

那么,網(wǎng)上曝出的高相似度的部分出現(xiàn)在哪里呢?

經(jīng)過檢索,記者發(fā)現(xiàn)是在博士研究工作介紹結(jié)束之后的綜述部分。該部分相對獨立,是對當(dāng)前對于結(jié)核病耐藥研究的綜合介紹。從內(nèi)容而言,這一部分是對研究同行在同一領(lǐng)域的科研成果進(jìn)行梳理和整理,與張文宏在博士期間的研究不存在關(guān)聯(lián)。

這篇綜述的尷尬在于,它在整篇論文中處于可有可無的位置。前面對于博士期間的工作(包括研究背景和意義,這是論文綜述本來的作用),論文已經(jīng)做了詳細(xì)的展示和記錄。而在最后一部分為什么加入綜述,記者咨詢了幾位博士畢業(yè)的研究人員。

有研究人員表示,博士論文并不是都要發(fā)綜述,可有可無;也有研究人員表示,(綜述)應(yīng)該放在前面,可能是有的學(xué)校模板要求不一樣……

一篇高質(zhì)量的博士研究論文,是否應(yīng)該被最后可有可無的綜述這一章影響,公眾在詳讀論文后應(yīng)該會有自己的判斷。

標(biāo)簽: 博士論文 結(jié)核桿菌 分子生物學(xué) 科技記者

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